1、录为X/Y。 其中X、Y分别为该位点上两个不同的等位变异，小片段数据在前，大片段数据在后，无效等位变异的大 小记录为0/0。三倍体和四倍条带大小记录方式类推。 7.5 结果判定及表述 7.5.1 将获得样品的等位基因变异数据与附录A.3数据库中品种比较: 4 a) 若为二倍体，品种相似度(S)按照下面的公式计算: 2N; s=一一.TX 100 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . (1) Ni + Nj 式中: 5一一相似度，单位为百分率(%); Nij 品种i和j之间共有的等位基因数目:
2、此一一品种i中出现的等位基因数目: 八;品种i中出现的的等位基因数目。 b) 若为二倍体，品种相似度(S)按照下面的公式计算: DB37/T 4030-2020 3N; s=一一TX 100. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . (2) Ni + Nj 式中: 5 相似度，单位为百分率(%); Nij一一品种1和J之间共有的等位基因数目; 肌品种i中出现的等位基因数目; 八5一一品种1中出现的的等位基因数目。 推荐使用本标准附录B配用的苹果品种鉴定系统软件，该软件预装了附录A.3的标准样品数
3、据库， 并且按照以上公示设计计算程序，输入待测样品的微卫星数据，运行程序可以直接得到品种相似度最高 的相似品种信息。该软件需要在Java运行条件下安装使用。 7.5.2 结果要IJ定及表述 判定方法如下: a) 品种间相似度90%，判定为不同品种: b) 品种间相似度90%S100 %时，判定为近似品种: c) 品种间相似度=100%，判定为疑似品种。 对于b)和c)的情况，按照GB!T19557. 1和NY!T2424-2013的规定进行田间鉴定。 5 DB37/T 4030-2020 附录A (规范性附录) PCR扩增用引物序列信息及参考数据库 PCR扩增用号|物序列信息见表A.1o 表A
4、.1 PCR扩增用引物序列信息 序 名称 引物 序列町，-3 ) 5端标记荧光基团扩增条件 扩增大小 文献来源 号方向bp l CH01d08 F ctccgccgctataacacttc 238-290 R actctggagggtatgtcaaag 2 CH01e01 F ggttggagggaccaatcatt 106-120 R cccactctctgtgccagatc l、GeraldS. Dangl 3 CH02b03b F ataaggatacaaaaaccctacacag Judy Yang 77-109 R gacatgtttggttgaaaacttg Deborah A.
5、Golino 4 CH02b07 F ccagacaagtcatcacaacactc Thomas Gradziel. A 180-202 R atgtcgatgtcgctctgttg practical method 5 CH02b10 F caaggaaatcatcaaagattcaag for almond cultivar 121-1,59 R Caagtggcttcggatagttg identificat ion 6 CH02b12 F ggcaggctttacgattatgc and parental 101-143 R cccactaaaagttcacaggc 94 0C 2
6、mi口30 analysis using 7 CH02d11 F agcgtccagagcaacagc simple sequence sec; 118-148 R aacaaaagcagatccgttgc repeat markers 94 0C 30 sec, 8 CH02f06 F ccctcttcagacctgcatatg 135-1,58 52 0C 30 sec, Euphytica (2009) R actgtttccaagcgatcagg 168:41 -48 72 0C 30 sec, 9 CH02g09 F tcagacagaagaggaactgtatttg 98-138
7、2、L 40 cycle; R Caaacaaaccagtaccgcaa Gianfranceschi, N. 72 0C, 10 mino 10 CH02h11a F cgtggcatgcctatcatttg 104-132 Seglias,R archini, R ctgtttgaaccgcttcctc M. Komjanc, C 11 CH03d07 F caaatcaatgcaaaactgtca 186-226 Gessler. Simple R ggcttctggccatgatttta seque口cerepeats 12 CH04d02 F cgtacgctgcttcttttgct
8、 118-146 for the genetic R ctatccaccacccgtcaact an日lysisof apple. 13 CH04d10 F gagggatctgtagctccgac 138-204 Theor Appl Gen巳t R tggtgagtatctgctcgctg (1998) 14 CH05c07 F 111-149 96:1069-1076 tgatgcattagggcttgtactt R gggatgcattgctaaataggat 15 CH05g03 F gctttgaatggatacaggaacc 135-192 R cctgtctcatggcattg
9、ttg 6 DB37/T 4030-2020 PCR反应体系见表A.20 表A.2 PCR反应体系 试剂名称工作液浓度25L反应体系加样体积/L dNTP 2.5 mmol/L 2L PCR缓冲液10X 2. 5L Taq DNA聚合酶5 U/L O. 3L 上游引物10 pmol/L O. 3 下游引物10 pmol/L O. 3 DNA模板100:1:50 ng 2 超纯水17.6 7 DB37/T 4030-2020 部分苹果品种SSR基因型数据见表A.30 表A.3 部分丰果品种SSR基因型数据 品种果实或者SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位
10、点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点 茎枝CH02b 12 CHO 1eO 1 CH02b03b CH02b 10 CH02d11 CH02f06 CHO 1d08 CH02b07 CH02日09CH02h11a CH03d07 CH04d02 CH05c07 CH05g03 CH04d10 Akagi Akane Akibae Fruiting 128/144 114/116 79/95 Frui t ing 130/130 114/122 95/95 Fruiting 130/140 112/116 79/95 Akita Gold Fruiting 1
11、44/144 112/116 79/79 129/137119/121148/162275/275110/132111/120124/134 185/199 138/152 153/153 166/170 168/191 129/141 121/ 133 148/162 244/297 130/132 111/ 138 107/124 183/203 126/152 117/153 166/174 168/209 125/129 119/133 148/162 244/244 110/112 107/120 132/134 185/199 126/152 117/153 166/170 154
12、/191 125/135 119/133 142/148 244/254 112/132 107/120 132/134 203/223 126/126 117/143 166/170 164/191 Aodai3 Rootstock 146/148 110/122 91/101 118/149 127/133 144/162 244/260 110/112 138/152 107/132 160/223 126/144 117/127 140/166 166/176 Baskatong Others 134/134 126/138 91/ 10 1 121/ 139 123/125 152/
13、152 242/299 104/110 103/138 140/146 181/ 181 126/134 143/151 162/166 150/152 Braeburn Fruiting 144/146 112/114 99/99 123/161 123/133 154/154 258/258 110/110 111/136 132/136 203/223 126/126 129/153 166/166 164/209 Chinatsu Frui ting 130/134 114/114 95/99 127/141 133/133 144/148 254/297 110/132 111/12
14、0 124/132 203/203 126/138 117/117 140/166 166/168 Cox日 Orange Pippin Fruiting 132/144 110/114 75/97 Cripp s Fruiting 144/146 112/116 79/97 Pink Discovery Frui ting 130/142 114/114 95/97 123/135121/133154/158244/258110/12497/111 107/132215/215126/126129/129168/199154/209 125/129 119/149 148/148 254/2
15、58 118/124 120/120 132/132 185/223 126/126 145/153 170/174 164/191 133/133 121/ 133 148/162 244/297 118/130 107/111 128/132 183/203 126/152 117/143 140/166 164/164 Fiesta Fruiting 130/132110/11475/95 123/129121/133154/162258/275112/12497/111 107/132203/215124/126129/145168/189154/166 Fuj i Frui ting
16、 144/144 112/116 79/108 135/137 133/133 142/162 244/258 112/112 107/111 132/132 223/223 124/126 117/139 140/166 164/209 G.65 Rootstock 113/142 112/148 75/91 125/149 123/149 150/154 258/258 104/112 111/138 112/124/ 183/223 138/138 133/153 140/176 164/164 132 Gala Fruiting 132/144 114/116 75/79 129/13
17、5 119/121 142/162 244/275 110/118 111/ 120 134/136 185/215 126/138 117/143 170/199 154/191 Geneva Frui t ing 134/140 120/124 95/101 133/139 121/ 125 150/162 242/244 108/118 10 1/ 138 107/140 181/ 185 126/134 143/153 140/166 150/168 8 DB37/T 4030-2020 表A.3 部分苹果品种SSR基因型数据(续) 品种果实或者SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点
18、SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR立点 茎枝CH02b12 CHOleOl CH02b03b CH02bl0 CH02dll CH02f06 CHOld08 CH02b07 CH02g09 CH02hlla CH03d07 CH04d02 CH05c07 CH05g03 CH04dl0 Golden Fruiting 144/144 112/116 79/99 125/129 119/133 148/162 254/275 110/118 120/138 132/134 185/203 126/138 143/153 14
19、0/170 191/ 191 Delicious Granny Frui ting 144/150 114/116 81/103 125/129 133/149 150/162 258/258 110/114 120/138 132/132 189/223 124/126 143/145 174/189 166/209 Smith Gunmameiget Fruiting 128/144 112/116 79/79 135/137 119/133 142/148 258/275 112/132 111/ 120 132/134 185/223 124/152 117/153 140/170 1
20、64/191 su Hacnine Haruka Hatsuaki Frui ting 144/144/ 112/116 79/108 129/135/ 133/133/ 142/162 244/258/ 112/132 107/111 126/132 185/223 124/126/ 117/139/ 140/166/ 164/191/ 144 Fruiting 144/144 Fruiting 128/144 112/116 79/99 112/116 79/97 137 129/135 129/129 133 119/133 133/133 275 142/148 254/258 154
21、/162 275/275 110/112 110/112 111/120 120/136 134/136 203/203 107/134 185/199 138 126/138 126/126 153 117/143 143/153 197 166/170 170/197 209 191/209 191/209 Himekami Frui ting 130/144 112/114 79/95 135/137 121/133 162/162 244/275 112/112 107/111 107/132 203/223 124/126 139/153 166/197 164/168 Hokuto
22、 Frui ting 144/144/ 112/114/ 79/108 135/137/ 133/149 142/162 244/258 110/112 107/111/ 132/132/ 185/223 124/126/ 117/139/ 140/166/ 164/166/ 144 116 132 209 Honey Qu日enFrui t ing 130/146 114/116 91/108 161 125/161 121/133 148/162 258/275 112/112 120 107/120 107/134 203/203 152 126/126 153 153/153 170
23、166/197 191/209 Idar巳d Indo Iwakami Fruiting 130/144 114/116 95/97 129/161 121/133 154/162 275/297 112/112 111/136 107/126 199/203 124/152 145/145 166/189 166/209 Fruiting 140/144 114/116 79/97 137/147 133/149 142/148 258/258 110/118 111/167 132/132 215/223 124/152 117/153 166/166 154/209 Fruiting 1
24、28/144 114/116 97/108 129/135 121/133 142/154 244/244 112/112 107/136 107/132 203/223 124/126 117/153 140/166 164/168 Ml Rootstock 132/146 110/118 101/106 118/149 133/143 144/154 244/250 110/110 99/152 128/132 213/223 126/144 117/127 164/166 152/166 M2 Rootstock 144/148 110/118 91/101 118/149 127/13
25、1 144/154 250/293 110/110 136/138 128/130 160/223 126/126 131/153 140/166 152/164 M5 Rootstock 146/148 110/118 101/106 118/149 131/143 144/154 250/293 110/110 99/152 107/132 160/223 138/144 127/131 140/166 166/176 M7 Rootstock 146/148 110/118 91/101 137/149 131/143 152/154 244/250 110/110 99/136 128
26、/132 213/223 138/144 131/153 140/174 152/166 M8 Rootstock 144/148 110/122 101/106 118/129 127/131 144/162 260/293 110/110 99/152 128/132 160/223 126/144 117/127 164/166 152/166 9 DB37/T 4030-2020 表A.3 部分苹果品种SSR基因型数据(续) 品种果实或者SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点SSR位点
27、 茎枝CH02b12 CHOleOl CH02b03b CH02bl0 CH02dll CH02f06 CHOld08 CH02b07 CH02g09 CH02hlla CH03d07 CH04d02 CH05c07 CH05g03 CH04dl0 J onagold Fruiting 128/144 112/114/ 79/95/99 125/129/ 119/133 148/154/ 244/254/ 110/112/ 111/120/ 124/132/ 185/199/ 126/138 143/145/ 140/170/ 191/209 Jonathan Kanki Kins日1 Kio
28、u Kitakarni Kitaro Kizashi Fruiting 128/130 Fruiting 140/144 Fruiting 144/146 Frui t ing 144/144 Frui t ing 144/144 Frui t ing 144/144 116 112/114 95/97 112/116 79/79 114/116 79/108 116/116 79/97 112/116 93/108 112/116 79/79 Fruiting 132/132 114/116 75/79 137 129/137 125/129 125/135 125/129 129/149
29、129/135 121/133 133/133 119/133 133/149 133/133 133/133 162 275 154/162 244/275 142/162 244/244 148/154 254/258 148/162 244/254 150/154 275/297 142/162 244/275 118 112/132 110/112 110/112 110/112 112/114 112/112 138 111/136 107/120 111/120 120/120 107/120 107/120 134 107/124 134/134 132/134 132/132
30、107/136 107/132 203 199/203 185/223 185/203 185/223 185/223 185/223 126/152 152/152 126/138 138/152 126/138 126/126 153 145/153 117/153 153/153 153/153 143/153 117/143 197 166/197 166/170 166/170 140/166 170/174 140/170 168/209 164/168 191/209 154/154 168/191 191/209 127/135 119/133 142/154 244/244
31、110/118 120/120 132/134 203/215 124/138 117/131 140/199 166/191 Kotaro Fruiting 144/144 112/116 97/108 129/137 133/133 154/162 244/275 112/112 111/120 132/134 199/223 124/126 139/153 166/170 164/191 M.26 Rootstock 130/144 110/114 99/101 129/149 133/149 150/154 244/258 110/132 136/152 107/132 189/223
32、 126/138 127/143 164/174 164/168 M.27 Rootstock 113/146 112/116 91/97 135/149 133/149 154/154 258/293 112/124 111/136 128/132 213/223 126/138 143/153 140/140 164/166 M.9 Rootstock 144/146 110/116 91/101 129/149 131/133 154/162 244/293 110/112 136/152 107/128 223/223 126/138 127/153 140/164 164/166 M
33、alus Others 134/134 120/126 101/101 139/139 123/125 152/162 242/299 110/118 134/138 132/140 181/203 126/134 143/151 160/166 150/152 niedzwetzky ana McIntosh Fruiting 144/146 112/114 93/99 Megumi Fruit ing 130/144 114/114 91/97 Miki-life Fruiting 130/144 112/116 79/95 133/149 121/133 150/162 258/275
34、114/132 107/138 126/132 187/223 126/126 143/145 164/166 154/164 129/161 121/121 154/162 275/275 112/112 107/111 107/126 203/223 126/126 145/153 166/197 166/209 125/129119/133148/154244/244110/112111/120132/134 185/185152/152117/153140/170164/168 MM.106 Rootstock 132/144 112/116 97/97 123/137 123/133 150/162 277/293 110/110 136/138 132/132 203/223 124/126 117/145 140/189 154/225 Mo84日Rootstock 132/148 118/122 91/106 118/137 127/143 144/152 250/260 110/110 99/140 130/132 160/211 126/144 117/131 166/172 152/180 10 DB37/T 4030-2020 表
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