1、 CA. Enhanced cultivation of Helicobacter pylori in liquid media. J Clin Pathol. 1993 Aug;46（8）:750-3. PMID: 8408702 PubMed - indexed for MEDLINE 那时，我们研究小组在幽门螺杆菌研究方面做得比较“有名” ，许多国家的学者向我们要菌株。这就涉及到成活幽 门螺杆菌菌株转运问题。幽门螺杆菌是一种微需氧、很难生存的细菌，没有合适的环境，很快就会死亡。为此，我 在同事的启发和帮助下在实验室做了幽门螺杆菌生存试验，先确定合适的转运培养基，然后付诸实施。由此先后发
2、了两篇方法学论著： 1 Xia HX, Keane CT, OMorain CA. Determination of the optimal transport system for Helicobacter pylori cultures. J Med Microbiol. 1993 Nov;39(5):334-7. PMID: 8246249 PubMed - indexed for MEDLINE； 2 Xia HX, Keane CT, Chen J, Zhang J, Walsh EJ, Moran AP, Hua JS, Megraud F, OMorain CA. Transpo
3、rtation of Helicobacter pylori cultures by optimal systems. J Clin Microbiol. 1994 Dec;32(12):3075-7. PMID: 7883907 PubMed - indexed for MEDLINE） 与此同时， 我也大胆 “标准化” 幽门螺杆菌药敏试验方法， 发了论著 Standardization of disk diffusion test and its clinical significance for susceptibility testing of metronidazole agains
4、t Helicobacter pylori. Xia H, Keane CT, Beattie S, OMorain CA. Antimicrob Agents Chemother. 1994 Oct;38(10):2357-61. PMID: 7840570 PubMed - indexed for MEDLINE。 该 “标 准化”被多次引用。 此外，我也根据一时的想法做了一些小的试验（这些试验成功与否完全影响不到课题大局和毕业） ，包括尿素酶试 验与幽门螺杆菌菌量的关系，幽门螺杆菌在不同细胞株毒性的比较，发了两篇小文章 Xia HX, Keane CT, OMorain CA. Pre-
5、formed urease activity of Helicobacter pylori as determined by a viable cell count technique-clinical implications. J Med Microbiol. 1994 Jun;40（6）:435-9. PMID: 8006937 PubMed - indexed for MEDLINE； Xia HH, Gallagher C, Hyde D, Talley NJ, Keane CT, OMorain CA. Comparison between McCoy cell line and
6、HeLa cell line for detecting Helicobacter pylori cytotoxicity: clinical and pathological relevance. Ital J Gastroenterol Hepatol. 1999 Nov;31（8）:663-8. PMID: 10730556 PubMed - indexed for MEDLINE） 第六节 阴性结果也是结果：零不仅仅表示没有第六节 阴性结果也是结果：零不仅仅表示没有 曾有研究人员跟我说： “最近投了篇文章，主要内容是阴性结果，已被 N 个杂志拒了，除了追问为何结果是阴性(而 不是别的文
7、章发表的在别的细胞系的阳性结果)以外几乎没有别的问题(当然还有他们最容易、最拿手的问题： there are several English spelling/grammar mistakes)。” 我承认，阴性结果可能影响了审稿人及编辑的兴趣，但不一定是编辑拒稿的主要原因。拒稿原因可能包括： 1. 课题设计不具新意 螺旋网 www.H 第 7 页，共 12 页生物人的网上家园 美捷登生物科技有限公司 www.M 2. 结果不多且很肤浅- 3. 有意义的结果已在其他杂志发表 4. 语言问题。但这不是主要问题 5. 审稿人可能不太懂你的专业，不能领会阴性结果的意义 下面谈谈我这方面的经验。 首先
8、，我们的科研课题一定不会是凭空设计的，要么根据发表文献的直接证据（如文献报道某基因在癌症 A 的表达 增加，我们继续在癌症 A 做机理研究，或在癌症 B 中验证），要么根据现有理论和文献结果（如某新的基因/因子(n ovel gene/factor)在某癌症发生发展中的基因调节作用）。如果方法和材料没有错，我们就应该相信自己的结果。即 使是阴性结果也应该，也能够如实发表。应该承认，阴性结果的接受率和发表杂志的 IF 都较阳性结果低。但如果写 得好，也是可以发好杂志的，关键是引言和讨论部分一定要有逻辑性的，令人信服。 曾经有报道指出，幽门螺杆菌感染与糖尿病有关，而另有报道否认这种关系。这些报道要
9、么病理少，要么设计或方 法有问题。因此，我们利用一大型的前瞻性的糖尿病课题的标本（本课题非前瞻性，属于 Post hoc 分析）来验证 幽门螺杆菌感染与糖尿病及其相关症状的关系。我们的结果虽为阴性，但发表在 Am J Gstroenterol 上（Xia HH, T alley NJ, Kam EP, Young LJ, Hammer J, Horowitz M. Helicobacter pylori infection is not associated with diabet es mellitus, nor with upper gastrointestinal symptoms in
10、 diabetes mellitus. Am J Gastroenterol. 2001 Apr;96(4):103 9-46）。后来，我们的另一篇类似的阴性结果的论文也发在 Dig Dis Sci 上（Jones KL, Wishart JM, Berry M, Rus so A, Xia HH, Talley NJ, Horowitz M. Helicobacter pylori infection is not associated with delayed ga马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授） 复旦大学研究生公
11、共课程：科研论文的构思、撰写和发表复旦大学研究生公共课程：科研论文的构思、撰写和发表 图表制作与结果分析 复旦大学药理研究中心复旦大学药理研究中心 马 兰马 兰 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授） 1982年获沈阳药学院药学学士，1984年获中国医科大学免疫学 硕士，1990年获北卡罗来那大学生物化学博士。1995年起任上海医 科大学/复旦大学上海医学院神经生物学、药理学教授至今。现为教 育部长江学者奖励计划特聘教授、复旦大学药理研究中心主任、脑科 学研究院副院长。研究方向为分子神经药理学。在Cell等SCI刊 物发表论
12、文60余篇，指导的研究生论文中有多篇被评为全国优秀博 士学位论文或上海市优秀研究生论文。获国家自然科学二等奖、国家 教学成果二等奖、何梁何利科技进步奖、教育部科技进步一等奖、中 华医学科技一等奖、上海市科技进步一等奖、上海市自然科学一等奖、 上海市级教学成果一等奖。现为“Journal of Biological Chemistry”、 “Neuropharmacology”、“Molecular Pain”、“Neuroscience Bulletin”、 中国药物依赖性杂志、中国药物滥用防治杂志、复旦学报 （医学版）编委。 马兰教授马兰教授 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究
13、生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授） 图表是论文的重要部分 ?结果是论文的核心和主要部分 ?结果一般以图表形式呈现 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授） 图表在论文手稿中的位置 3. 图： 在图注后面，每个图一页 1. 表格：排在正文中参考文献的后边，每个表格一页 2. 图注：图注排在表格后面，另起一页 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授） 图表的作用 ?直观、高效地表达复杂的数据和观点 ?启发思考数据的本质、分析数据揭示的规律
14、 ?以较小的空间承载较多的信息 ?真实、准确地展示和反映数据 A picture is worth a thousand words. 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授） ? the greatest number of ideas Graphic Excellence is that which gives the viewer: ? in the smallest space ? with the least ink ? in the shortest time By Edward R. Tufte (Graphic
15、s Press): 1. The Visual Display of Quantitative Information 2. Visual Explanations 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授） 表 格 适于呈现较多的精确数值或无明显规 律的复杂分类数据和平行、对比、相关关 系的描述。 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授） 表格的基本结构 序号、标题 项目栏 表体 脚注 顶线、栏目线、底线（三线表） （一般没有竖线） 马兰教授（2007年11月
16、26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授）890 Radiology March 2003 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授） Cell, Vol. 112, 257269, January 24, 2003 Not so good 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授） 图 ?照片、其它纪实图象等记录性 ?地图 ?线形图、条形图、散点图等定量 ?示意图、流程图解释性 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学
17、研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授） 二个变量之间的定量关系（趋势、 连续变化） 条形图： 饼形图：比例 真实、直观、信息量大。 要对比强烈、重点突出 线形图： 照片： 自变量为分类数据 图的种类 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授） 缺乏对比、重点不突出 照片：照片：真实、直观、信息量大真实、直观、信息量大 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授） Molecular and Cellular Neuroscience 18,
18、 1325 (2001) NATURE | VOL 417 | 2 MAY 2002 标记帮助突出重点 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授） 因变量： 竖轴（标题、单位） 因变量： 竖轴（标题、单位） 自变量： 横轴（标题、单位） 线形图：二个变量之间的定量关系（趋势、连续变化） 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授） 条形图：自变量为分类数据 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授）
19、1. 图序和题目 2. 内容：用文字和符号表达图中未能表达的 必要信息，使读者不必依赖正文而理解图 所要说明的问题。 图 注图 注 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授） JBC （2001） 276: 4709-4716. 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授） 怎样正确地使用图表 1. 确定主题-你想表达什么观点？ 6. 是否表达了你的观点？ 5. 是否启发读者思考数据的本质和规律？ 4. 是否真实、有效地展示了数据？ 3. 那种图表最适合你的目的？
20、2. 图表还是文字更有效？ 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授） 1. 你想表达什么观点？ 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授） 没有必要时不要用 2. 用2. 用文字还是图表？ 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授） 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授） 浪费空间 数据重复 15.5 8 7.5 马兰教授（2007年11月26日） 复旦大学研究生课程“科研论文的构思、撰写和发表” （主讲教师：马兰教授
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