肺腺癌铁死亡相关LncRNA的筛选及风险预测研究.pdf
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1、基金项目:国家重大专项课题()通信作者:刘美娜:.肺腺癌铁死亡相关 的筛选及风险预测研究哈尔滨医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系()马宇杰 田 伟 张 薇 刘美娜 【提 要】目的 筛选铁死亡相关长链非编码()构建风险评分模型并进行肺腺癌患者的生存预测 方法 通过相关性分析、癌组织癌旁组织差异分析获得差异表达的铁死亡相关()使用配对算法获得 利用 筛选与生存相关 多因素 回归分析并构建风险评分模型计算 曲线的 值评估模型 利用单因素和多因素 回归分析风险评分是否具有独立预后价值分析生存时间、临床病理特征和化疗疗效等在高、低风险组之间的差别 结果相关性分析获取 个 差异分析获得 个 配对算法
2、获得 个 分析获得 个与生存相关 多因素分析得到 个 构建风险评分模型模型的 为.单因素和多因素分析提示风险评分可作为肺腺癌()的独立预后因素 患者化疗药物敏感性、分期、临床分期、生存时间和生存状态在高、低风险组之间差异有统计学意义 结论 利用 构建的肺腺癌风险评分模型可为预测肺腺癌患者预后提供依据 此外低风险评分患者对化疗药物敏感将为肺腺癌患者临床治疗提供参考【关键词】肺腺癌 铁死亡 生存分析 预后【中图分类号】.【文献标识码】./.()【】().().().().【】肺癌是全球癌症相关死亡的主要原因之一根据组织病理学分为非小细胞肺癌()和小细胞肺癌()其中肺腺癌()是 的主要病理类型 早期
3、通过手术治疗肺腺癌可以获得较好地治疗效果但其总体生存率仍然很低 年生存率仅为 免疫抑制、细胞增殖、肿瘤远处转移、药物抵抗等因素与肺腺癌患者低生存率紧密关联 铁死亡是一种铁依赖性新型的程序性死亡方式铁代谢异常会促进肿瘤细胞生长是癌症发生的危险因素与正常细胞相比癌细胞在增殖过程中过度依赖铁离子激活铁死亡通路有望改善癌症化疗药物耐药的困境为癌症治疗提供新的治疗方向长链 非 编 码 ()为大于 的 分子其不直接编码蛋白质但能调节蛋白编码基因的表达与蛋白质的合成更重要的是 与肿瘤发生、进展和转移等癌症相关事件高度相关 铁死亡相关 作为一类特殊的 在肿瘤的发生、发展过程中发挥极为重要的作用影响癌症患者的预
4、后有望成为肿瘤 治 疗 新 靶 点 如 通 过 与 相互作用降低癌细胞内铁离子和脂类 含中国卫生统计 年 月第 卷第 期量发挥抗肿瘤作用 患者 相关特征与其预后价值的关系研究甚少因此本研究利用 构建风险评分模型可以评估 患者预后并为肺腺癌患者临床治疗提供相关依据方 法.肺腺癌患者 和临床数据的收集在 网站(:/./)下载肺腺癌转录组数据包括 例癌组织和 例正常肺组织 根据 (:/.)文件对转录组数据进行注释区分 和 通过 网站获取肺腺癌患者临床信息提取性别、年龄、分期、临床分期、生存时间和生存状态等临床特征剔除生存时间不足 天的样本以及重复样本共纳入 例肿瘤样本和 例正常样本其中肿瘤样本中生存
5、时间为 年、年、年的病例分别有 例、例、例.肺腺癌铁死亡相关 的获取从 数据库提取 个铁死亡相关基因通过相关性分析提取并筛选肺腺癌 筛选标准:相关系数大于.小于.利用 软件“”包筛选癌组织和正常肺组织差异铁死亡相关()以.为筛选标准.配对规则首先构建 或 表达矩阵将 进行两次循环配对 假设 为 加 所构成 如果 表达量高于 则 标记为 否则 标记为 然后得到每个样本 的表达情况在所有的样本中计算 为 或 的比例 由于没有一定等级的 无法正确预测患者的预后因此当 的表达量为 或 的比例介于 与 之间时可以认为 与预后有关.建立风险评分模型首先采用单因素 回归筛选与预后相关的 并以.为筛选标准其次
6、为了防止单因素 回归分析获得的 过拟合使用“”包进行 回归再次筛选 同时使用交叉验证来确定 选择误差最小时的 作为最优 最后将筛选出的有统计学意义的 进行多因素 回归分析并构建风险评分模型 风险评分计算公式为:(表示最终纳入评分的 个数表示 的表达情况表示 的系数)根据风险评分公式计算每位患者的风险评分.模型的评价使用“”包绘制多个时间点 曲线分别计算 年、年和 年 值评估风险评分模型绘制 曲线计算约登指数确定模型的最佳临界值根据临界值将肺腺癌患者分为高风险组和低风险组加载“”包绘制 曲线分析高风险组和低风险组患者的生存差异对风险评分进行单因素和多因素 回归分析确定风险评分是否具有独立预后价值
7、.统计分析统计分析由 .版软件完成 利用 检验分析各个临床特征的高、低风险组之间的差异 采用 符号秩和检验分析各临床特征不同组之间的风险评分差异 采用 秩和检验比较化疗药物的半数抑制浓度()在高、低风险组之间的差异结 果.的筛选铁死亡相关基因与肺腺癌患者 进行相关性分析获得 个 在肿瘤样本和正常样本之间进行差异分析获得 个 见图 其中 个表达上调 个表达下调见图 本研究纳入 例肺腺癌患者的临床基线资料见表 图 差异表达铁死亡相关()热图()和 的火山图().表 例肺腺癌患者的临床病理特征临床特征例数年龄(岁):/性别:女性/男性/分期:/分期:/分期:/分期:/.的筛选 个 通过配对算法获得
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