7、DNA拷贝数变化.docx
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1、分子机制研究套路(七)拷贝数变异课题: A基因拷贝数变异与B疾病发生的相关性研究1概念介绍:近来的研究表明在人类与其他哺乳类动物基因组序列中DNA拷贝数变异(Copy number variation, CNV)在生物的进化、发育及疾病的发生、发展过程中均具有重要作用。所谓拷贝数变异是指与基因组参考序列相比,基因组中1 kb的DNA片段插入、缺失和/或重复,及其互相组合衍生出的复杂变异,主要表现为亚微观(Submicroscopic)片段的缺失和重复。CNV是基因组结构变异(Structural variation)的重要组成部分。CNV位点的突变率远高于单核苷酸多态性(Single nucl
2、eotide polymorphism, SNP),是人类疾病的重要致病因素之一。CNV的形成机制有多种,可分为DNA结构重排和DNA错误复制两大类。CNV可以导致呈孟德尔遗传的单基因病与罕见疾病,同时也与复杂疾病相关,包括癌症。其致病的可能机制有基因剂量效应、基因断裂、基因融合和位置效应等。例如,拷贝数变异可以通过破坏蛋白编码基因的活性部分、改变某个基因的表达“量”或者破坏基因活性的调控区域,从而影响基因的活性。越来越多的证据显示基因组DNA拷贝数变异是肿瘤相关基因活性改变的一个重要的调控因素。值得注意的是,“拷贝数变异(Copy number variation ,CNV)”这一术语主要是
3、指遗传性的/胚系(Inherited/germline)拷贝数变化,与之对应的另一术语“拷贝数畸变(Copy number alteration ,CNA)”主要是指体细胞(Somatic)拷贝数变化,例如在癌症发生过程中新出现的DNA片段拷贝数变化。2研究思路:2.1研究对象的采集22.2 A基因全部25个外显子区域CNV的变化22.3 A基因14号外显子杂合性缺失的验证22.4 A基因14号外显子杂合性缺失的组织特异性22.5 A基因14号外显子杂合性缺失对蛋白表达的影响22.1研究对象的采集本研究共纳入例B疾病患者和例健康者。两组研究对象的性别、年龄、受教育程度等情况无明显差异。2.2
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